屋久島へ東京からの直行便は出ていません。
2009年9月より、大阪（伊丹）と屋久島を結ぶ直行便(飛行機)が、 2011年3月からは、福岡−屋久島間が就航いたしました。
さらに、2011年3月の九州新幹線全線開通により、鹿児島経由での屋久島へのアクセスが非常に便利になりました。